1941-ben csatlakozott a brit légierőhöz, mikor kimondottan női pilótákat kerestek felhívásukban. Mary Ellis körülbelül 1000 géppel repült négy év alatt, köztük 400 vadászrepülőt és 47 Wellington bombázót. A háború után Ellis a Sandown repülőteret igazgatta 1950 és 1970 között.
Ellis 101 évesen halt meg otthonában, ő volt az utolsó élő pilótanő, aki szolgált a második világháborúban. A Wight-szigeten élő asszonyt idén tűntették ki a sziget érdemrendjével, Dave Stuart, a tanács elnöke úgy hivatkozott rá, mint „nemzeti, nemzetközi hős és a sziget hőse”. Haláláról számos barát és pilóta megemlékezett.
